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近日,基因组所猪基因组设计育种创新团队在《ACS合成生物学(ACS Synthetic Biology)》杂志上在线发表了题为“Highly Sensitive CRISpR/Cas12a-Based Fluorescence Detection of porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus”的研究论文,该论文被选为同期封面文章。这项研究首次创建了“一管式”快速检测猪繁殖与呼吸综合征病毒(pRRSV)的荧光检测技术,可以在25分钟内精准检测出pRRSV。
猪繁殖与呼吸综合征(pRRS)是猪群发生以繁殖障碍和呼吸系统症状为特征的一种急性、高度传染的病毒性传染病,主要由pRRSV导致。因此,早期发现和快速精准检测出pRRSV是有效防控pRRS疫病的关键。目前的病毒检测技术如环介导等温扩增(LAMp)、定量逆转录pCR(RT-qpCR)和数字pCR(ddpCR)等存在假阳性高、程序复杂、检测耗时长、操作要求高且设备昂贵等不足。因此,开发一种快速简便、准确灵敏且低成本的检测技术非常必要。
本研究将CRISpR-Cas12a(又称Cpf1)系统、逆转录重组酶聚合酶扩增(RT-RpA)组分和单链DNA荧光报告器合为一管,在37度孵育25分钟后,便可通过便携式发光仪(蓝光仪或紫外发光仪)实现可视化快速检测。相比传统的RT-qpCR和其它检测方法,该技术的灵敏度可达到1拷贝/μL,且仅需25分钟就可得到结果。
高灵敏性荧光检测技术基于CRISpR-Cas12a,具有简便、精准、快速、低成本等优点,可用于pRRSV等各种相关病毒的快速检测。该团队还建立了非洲猪瘟等其它疫病病毒的检测技术,已申请4项国家发明专利,将为猪的疫病防控和抗病育种提供有力的技术保障。
基因组所助理研究员刘思远为论文第一作者,唐中林研究员和华中农业大学谢胜松副教授为共同通讯作者。该研究得到深圳市技术攻关项目和中国农业科学院创新工程等项目的资助。
文章全文链接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acssynbio.1c00103
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