定向进化是一种用于工程蛋白质的强大技术
几千年来,啤酒酿造者使用芽殖酵母酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的专门菌株酿造啤酒。然而,酿酒酵母的历史起源尚不清楚,因为酿造早于微生物的发现。
3月5日在罗切斯特大学的Justin Fay领导的开放获取期刊pLOS Biology上发表的一项新研究表明,现代酿造菌株来自欧洲葡萄酒和亚洲黄酒菌的混合物。这一发现表明啤酒酵母从历史上的东西方发酵技术转移中出现,类似于通过丝绸之路转移驯化的植物和动物。
任何驯化生物的历史起源往往因最近的迁徙,基因流动和与其他群体混合而蒙上阴影。虽然对古代DNA的分析一直是重建许多历史事件的福音,但古代发酵饮料和用于生产它们的微生物却无法获得。然而,众所周知,许多啤酒菌株都是多倍体 - 它们的基因组有两个以上的拷贝 - 这使它们能够与其他种群保持隔离,并为研究人员提供其祖先的生存遗迹。
为了重建啤酒菌株的历史,研究人员对啤酒菌株的基因组进行了测序,并将其与来自世界各地的一组参考菌株进行了比较。啤酒菌株形成了四个相关的组:两个啤酒,一个啤酒和一个包含啤酒和烘焙菌株的组。所有这些组都表现出来自欧洲葡萄酒菌株和亚洲黄酒菌株的混合血统。菌株还含有在任何其他群体中不存在的新基因变体。这些新变体的起源不太清楚,但它们的丰度表明它们来自一个未定性或灭绝的种群。由于它们的多倍体基因组不是静态的,因此难以完全重建啤酒菌株进化过程中事件的顺序和时间。在细胞分裂期间,它们的多倍体基因组发生了变化,
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